Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms