Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms