Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKP3Q9Y446 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms