Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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SH3BP1Q9Y3L3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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