Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms