Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms