Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAK1Q9UPV9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms