Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSR3Q9UNL2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms