Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms