Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms