Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL4Q9UJQ4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL4Q9UJQ4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms