Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS51Q9UID3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms