Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLKQ9UBT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms