Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms