Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms