Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT57Q9NWB7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT57Q9NWB7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms