Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms