Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMPRSS4Q9NRS4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms