Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CYLDQ9NQC7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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