Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REEP4Q9H6H4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms