Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms