Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BARHL1Q9BZE3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms