Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NIFKQ9BYG3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms