Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms