Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms