Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms