Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms