Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FUNDC2Q9BWH2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FUNDC2Q9BWH2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms