Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP58Q9BVL2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms