Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms