Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGIP1Q9BQI5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms