Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRBNQ96SW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRBNQ96SW2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms