Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms