Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms