Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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