Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CPNE2Q96FN4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CPNE2Q96FN4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms