Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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GTF3C6Q969F1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C6Q969F1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C6Q969F1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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