Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTTNBP2Q8WZ74 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CTTNBP2Q8WZ74 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms