Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASKIN1Q8WXD9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN1Q8WXD9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms