Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms