Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEDD1Q8NHV4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms