Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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