Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3HQ6NTF7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3HQ6NTF7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms