Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms