Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VIRMAQ69YN4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms