Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD13Q5VXD3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms