Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
MYOM3Q5VTT5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MYOM3Q5VTT5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms