Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATAD3CQ5T2N8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms