Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALFQ53S48 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALFQ53S48 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms