Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC92Q53HC0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms